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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
9/23 |
<b>本堂結構生物學概論的學習內容介紹：
1）結構生物學指什麼？
2）結構生物學在生化科技和生物醫學之角色。
3）一個綠茶的故事
4）我們用 UCSF ChimeraX 來看蛋白質。
5）學期末，你要會做蛋白質進行形變的電影。</b> |
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第2週 |
9/30 |
<b>1）觀看和分析生命分子結構軟體介紹
2）蛋白筫和其他生命大小分子有什麼特色？
3）我們來看胺基酸在結構組成和功用上的本領(1/2）</b> |
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第3週 |
10/07 |
<b>1）我們來看胺基酸在結構組成和功用上的本領(2/2）
2）用軟體來看看，這些組合起來的結構，施展功能的實例。</b> |
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第4週 |
10/14 |
<b>蛋白質的二級結構是基礎：五大基本結構。</b> |
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第5週 |
10/21 |
<b>1) 蛋白筫的二級結構的化學性質
2) 蛋白笕三級和四級結構：五大構形組合型態。
3) 蛋白質結構分類
4) 以軟體看基本結構</b> |
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第6週 |
10/28 |
<b>1)Protein functions within a cell.
2)Functional domains.</b> |
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第7週 |
11/04 |
<b>1）結構解析三大方法：
2）X-光, CryoEM 和 NMR 的特色
3）我怎麼選，用那一個方法呢？
4) About X-ray diffraction</b> |
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第8週 |
11/11 |
<mark>
期中考
</mark> |
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第9週 |
11/18 |
<b>1）X-ray diffraction technology
2) 從基因到做出蛋白質，生物資訊上的處理。</b> |
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第10週 |
11/25 |
<b>1) Bring Your Own Computer (BYOC), 實際來用軟體解結構
* MR-practice-List.zip: Contains a .pdb, sequence in fasta file format, and a .sca for lysozyme.
2) Unplugged Bioinformatics in 2nd structure prediction</b> |
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第11週 |
12/02 |
<b>【No class】
<b>Prepare your group report</b>
Think about: can you display those binding with ChimeraX?
蛋白質行使功能時的力量：
1）雙硫鍵
2）離子鍵
3）氫鍵
4）疏水結合力
5）凡德瓦力和其它</b> |
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第12週 |
12/09 |
<b>第一組：Central Dogma 路徑</b> |
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第13週 |
12/16 |
<b>第二組: Central Dogma 路徑
第三組：感光蛋白質</b> |
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第14週 |
12/23 |
<b>第一組：Central Dogma 路徑
第五組＋第六組：離子通道蛋白質</b> |
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第15週 |
12/30 |
<b>第七組＋第八組：G-protein coupled receptor - G proteins</b>
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第16週 |
1/06 |
<b>第九組＋第十組報告：Two-component System
第四組: 感光蛋白質</b> |
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第17週 |
1/13 |
（因首次規劃 16 週課程。或許所有報告向下延後一週或兩週。可討論。） |